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Dernière mise à jour : Mai 2018

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ECOSYS Bienvenue

UMR ECOSYS - Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes

Offre de thèse EcoSys : structure fonction de blé

Intégration de la morphogénèse racinaire et des flux de carbone vers la rhizosphère dans CN Wheat, un modèle structure fonction de blé.

Encadrement

Le thème proposé a une situation centrale dans les thématiques de l’UMR ECOSYS et l’encadrement impliquera quatre scientifiques aux compétences complémentaires :
• Bruno Andrieu (DR, pôle Ecophysiologie-Bioclimatologie) pour les aspects modélisation de la plante (système aérien) ;
• Céline Richard-Molard (CR, pôle Ecophysiologie-Bioclimatologie) pour la caractérisation et la modélisation des systèmes racinaires ;
• Patricia Garnier (DR, pôle Sciences du sol) : Modélisation des transferts et transformation dans le sol ;
• Cornelia Rumpel (DR, pôle Sciences du sol) : Caractérisation des exportations de carbone vers le sol.
Le travail associera des équipes avec lesquelles nous collaborons déjà: les aspects modélisation seront développés en collaboration avec C. Fournier et C. Pradal de l’équipe INRA-INRIA Vplant qui développent la plateforme de modélisation des plantes « Open Alea » (http://openalea.gforge.inria.fr/). Nous pensons associer aussi Loïc Pages (UMR PSH, Avignon) pour les choix des modèles racinaires et l’estimation des paramètres associés et Yakov Kuzyakov (Bayreuth Univ.) sur les aspects rhizodéposition

Résumé de la proposition

Les plantes exportent vers le sol de grandes quantités de carbone par rhizodéposition. Ces exportations jouent un rôle majeur comme source de carbone pour la faune et la vie microbienne et impactent de façon significative l’économie du carbone de la plante. Les quantités exportées varient fortement au cours du développement ontogénique des plantes et en fonction de leur état physiologique. L’évolution de l’architecture racinaire et les équilibres source-puits dans la plante ont été identifiés comme parmi les facteurs sous-jacents à ces 2 variations, mais on manque d’une formalisation de ces hypothèses sous forme de modèle mécaniste, qui permettrait d’explorer comment les conditions de croissance et les paramètres fonctionnels de la plante régulent ces exportations.
Le projet de thèse aura pour coeur la mise au point et l’évaluation d’un modèle sol-plante, intégrant explicitement les exportations de carbone par les racines, en prenant le blé comme espèce modèle. Le travail expérimental inclura des caractérisations du système racinaire et le suivi de la rhizodeposition par marquage isotopique. La composante modélisation s’appuiera sur des modèles déjà existants pour les systèmes aériens et le sol, et devra définir et formaliser les hypothèses concernant le fonctionnement racinaire et analyser le fonctionnement intégré du système.

Voir aussi

L’Ecole Doctorale Abies organise du 7 au 9 juin 2016 une audition des candidats pour l’attribution des allocations doctorales. Voir :
http://www.agroparistech.fr/abies/index.php/fr/futur-etudiant/sujets-concours-2016

Documents à télécharger