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Dernière mise à jour : Mai 2018

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BIOGER

BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture - Champignons Pathogènes des Plantes

Soutenance de HDR

Soutenance de HDR
Le 2 octobre 2020, Anne-Sophie Walker soutiendra son HDR intitulée "Understanding the adaptations of phytopathogenic fungi to improve their management in the context of agroecology"

Adaptation can be defined as an optimization of the phenotype in response to the selection imposed by a given environment. In agricultural systems, a lower heterogeneity of selection, compared to the wild environment, promotes the adaptation of phytopathogenic fungi, all the more since they have highly adaptive biological traits and lifestyles. The most detrimental examples of pathogen adaption in agriculture are the adaptation to new hosts or cultivars, leading to emerging diseases, or to antifungals, leading to resistance and loss of efficacy of plant protection products. Therefore, beyond the applied perspectives, studying fungal adaption in agroecosystems, especially to antifungals, offers a unique opportunity to understand theoretical evolution under regimes of heterogeneous directional selection, offering contrasted degrees of intensity and of spatiotemporal deployment, and opportunely observable on contemporary time scales.

This HDR memoire reports highlights from 20 years of research aiming 1/ at understanding the processes and traits of fungal adaptation, 2/ at predicting and managing adaptations to antifungals in pathogen populations and 3/ transferring knowledge and tools on resistance towards agriculture professionals. Main approaches include microbiology, modelling, classical and population genetics and experimental evolution, deployed primarily on Botrytis cinerea and Zymoseptoria tritici as biological models. Based on the established findings, pushing science forward in the context of agroecology will include a better prediction of mechanisms underlying fungal adaptation, optimizing and adapting resistance management to the new opportunities in plant health and accompanying stakeholders into changing their practice towards resilient agriculture.