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Dernière mise à jour : Mai 2018

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BIOGER

BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture - Champignons Pathogènes des Plantes

BIOGER and the UMR Agroecologie in Dijon jointly offer a Postdoctoral position

Postdoc position available at Bioger and Agroecologie (Dijon).
Cryptogamic diseases of grapevine: Epigenetic mechanisms involved in fungal pathogenesis and plant immunity

Cryptogamic diseases of grapevine:
Epigenetic mechanisms involved in fungal pathogenesis and plant immunity

Scientific and societal background
One of the major current challenges in viticulture is to develop alternative solutions to the use of pesticides. In this context, INRAE is coordinating the interdisciplinary VITAE project, which aims to move from a curative approach to an agro-ecological approach based on prophylaxis, monitoring and improved resilience of winegrowing systems.
https://www.inrae.fr/actualites/cultiver-vigne-pesticides-lancement-du-projet-vitae.
The VITAE project is based on the production of new knowledge, among other things, on the molecular mechanisms that govern the interactions between pathogens and the vine, with the aim of developing new protection strategies. Thus, the UMR Agroécologie working on vine immunity (Dijon) and the UMR BIOGER dedicated to phytopathogenic fungi (Grignon, Paris region) are jointly offering a post-doctoral research position (24-month fixed-term contract) for a person willing to work successively in Grignon and Dijon. Alternatively, two people could be recruited (two 12-month fixed-term contracts), one to develop the programme at the Dijon site and the other at the Grignon site.

Missions
The project of the researcher(s) recruited will concern two aspects of grapevine immunity and its regulation by the host or the pathogen: (1) the role of small interfering RNAs (siRNAs) and (2) that of grapevine histone deacetylases.
(1) The grey mould agent Botrytis cinerea produces siRNAs that hijack the host plant's silencing mechanisms and thus manipulates defence genes. While these mechanisms have been demonstrated in the model plant Arabidopsis thaliana (Weiberg et al., 2013, Science 342(6154):118), they remain unknown in grapevine. Recent results from our laboratory indicate that B. cinerea strains specialised on grapevine possess retrotransposons in their genome that are at the origin of a specific repertoire of siRNAs (unpublished). The objective is to characterise the role of these fungal siRNAs in the interaction with grapevine and, in particular, to identify the targeted genes and the impact on host immunity. In parallel, an initial study of the siRNAs produced by the vine in response to pathogens will be carried out in order to evaluate their potential in the development of new control methods.
(2) Work carried out within the UMR Agroécologie on the model species Nicotiana tabacum has shown that the intensity of plant responses induced by avirulent microorganisms or by Defence Elicitors (DE) is negatively regulated by a family of enzymes specific to plants, type 2 histone deacetylases or HD2. The objective is double: i) to develop biocontrol products effective against grapevine diseases with a new mode of action combining disinhibition and activation of plant defence responses; ii) to identify the mechanisms of inhibition of grapevine defence responses by searching for the protein partners and/or gene targets of HD2.

Required profile(s)
We are looking for one (or alternatively two) person(s) with a PhD in Biology and a strong background in molecular biology / biochemistry, plant pathology, plant biology and microbiology. Experience in cloning and molecular genetics is highly recommended. In addition, the following qualities are expected: rigour, scientific curiosity, ability to work independently and to take initiative, ability to write and communicate orally in English.

Localisations
The experiments are planned for the first year in the UMR BIOGER (ECCP team) and the second year in the Agroecology unit.
-        Unité de recherche en BIOlogie et Gestion des Risques en Agriculture (BIOGER), Grignon (moving to Palaiseau at the end of 2022). https://www6.versailles-grignon.inrae.fr/bioger/Equipes/ECCP-Effecteurs-de-la-Communication-Champignon-Plante
-        UMR Agroécologie – Dijon. https://www6.dijon.inrae.fr/umragroecologie/Poles-de-Recherches/Mecanismes-et-gestions-des-Interactions-Plantes-Microorganismes

How to apply
An application including a letter of motivation and a detailed CV including the emails of two scientific references should be sent to benoit.poinssot@inrae.fr, stephane.bourque@inrae.fr , muriel.viaud@inrae.fr and marielle.adrian@u-bourgogne.frStarting date: Early 2022
Salary depending on previous experiences.