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31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2021

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BIOGER

BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture - Champignons Pathogènes des Plantes

Contrats

2019-2022. "CHOPIN"
"Deciphering in planta CHrOmatin dynamics of a Phytopathogenic fungus during Infection"
Coordination: J. Soyer
Partenariat : IPS2, UMR INRA-CNRS-UEVE, Equipe Chromosome Dynamics (C. Raynaud)
Financement : ANR

2019-2021. “Atipical"
“Actualisation et pérennisation des connaissances et des ressources biologiques et moléculaires sur les maladies foliaires de colza”
Coordination : MH. Balesdent
Partenariat : Terres Inovia (A. Penaud), Geves (P. Bagot), INRA IGEPP (L. Bousset)
Financement : Casdar (Ministère en charge de l’agriculture)

 
2018-2019. “ChromaDyn"
“Deciphering the influence of chromatin dynamics on the expression of effector genes in a leaf-penetrating fungal pathogen”
Coordination : I. Fudal
Financement : INRA SPE

 
2017-2019. “Phytoadapt"
“Adaptation à de nouvelles espèces non-hôtes chez les champignons phytopathogènes des grandes cultures”
Coordination : JL. Soyer
Financement : INRA SPE

 
2017-2019. “MoGeR"
“Des connaissances à la modélisation : vers un outil de simulation convivial pour tester des scénarios de gestion des résistances variétales dans le cas du Phoma du colza”.
Coordination : MH. Balesdent
Partenariat : Agrosolutions groupe InVivo, INRA-BIOGER (F. Carpentier, BIOGER, Equipe "Epidémiologie des maladies fongiques du blé"), INRA-ISA (S. Touzeau)
Financement : INRA metaprogramme SMaCH

 
2016. "Effector evolution across diverse (phytopathogenic) fungal genomic landscapes".
Accueil de Ralph Dean, senior scientist, à BIOGER.
Coordination : T. Rouxel
Financement : INRA SPE

 
2015-2018. “StructuraLep".
“Structural and functional characterization of Leptosphaeria maculans effectors and of their interactants”.
Coordination : I. Fudal
Partenariat :  UMR CNRS-CEA-Université Paris-Sud I2BC
Financement : ANR (Appel « Génériques, Défi sociétal: Sécurité alimentaire et défi démographique”)

 
2015-2019. “MetaPhoR"
“Exploitation des données de métatranscriptomique issues de “LeptoLife" pour l’identification et le suivi de nouvelles sources de résistance au phoma chez le colza”
Coordination : T. Rouxel
Partenariat : INRA-IGEPP, Genoscope
Financement : Promosol

 
2015-2017. “DynamiC-Rlm7"
“Territoires, idéotypes et dynamique adaptative : acquisition de critères d'objectivation de l'état du contournement de la résistance Rlm7 du colza au phoma”
Coordination : MH. Balesdent
Partenariat : In Vivo-Agrosolutions
Financement : Projet ANR du Labex BASC, appel “innovation en partenariat”

 
2014-2017. Bourse de thèse de Julie Gervais
“Identification et analyse fonctionnelle des effecteurs tardifs impliqués dans la colonisation systémique du colza par Leptosphaeria maculans
Coordination : MH. Balesdent

Directeur de thèse : T. Rouxel
Co-financement : INRA-CETIOM

 
2014-2015. “La distribution des nucléosomes chez les champignons filamenteux phytopathogènes joue-t-elle un rôle dans le contrôle de l’expression des effecteurs ?”
Coordination : I. Fudal
Partenariat : UR INRA MYCSA.
Financement : INRA SPE

 
2014. Projet France Génomique “LeptoLife”
“Un projet de transcriptomique et de métagénomique pour explorer les phases “cachées” du cycle infectieux de Leptosphaeria maculans
Coordination : T. Rouxel
Partenariat : UMR INRA-IGEPP, Genoscope.
Financement : France génomique

 
2013-2017. ANR “GANDALF”
“Génomique et adaptation des traits d’histoire de vie des champignons impliqués dans les interactions avec la plante hôte”
Coordination : François Delmotte (INRA Bordeaux)
Partenariat : ESE, INRA-BGPI, INRA-BIOGER (EPLM + équipe Epidémiologie), INRA-SAVE, INRA-IAM, INRA-BIOGECO, IRHS, INRA-URGI, LIPM
Financement : ANR (BioAdapt)

 
2013-2014. “Caractérisation temporelle du cortège de micro-organismes associés aux résidus de culture de colza infectés par Leptosphaeria maculans
Coordination : V. Laval
Financement : INRA SPE

 
2012-2016 : Projet CTPS “ICoSCoP”.
“Intégration des nouvelles connaissances sur les interactions plantes-champignon pour développer des stratégies de gestion des résistances du colza au Phoma”
Coordination : MH. Balesdent
Partenariat : F. Carpentier (BIOGER, Equipe "Epidémiologie des maladies fongiques du blé"), R. Delourme (INRA-IGEPP), M. Leflon (Terres Inovia), M-H. Jeoffroy (INRA Agronomie)
Financement : ONEMA (suite à AAP Casdar CTPS)

 
2012-2016 : "K-Masstec"
“Knowledge-driven design of management strategies for stem canker specific resistance genes”.
Coordination : MH. Balesdent
Partenariat : F. Carpentier (BIOGER, Equipe "Epidémiologie des maladies fongiques du blé"), R. Delourme (INRA-IGEPP), M. Leflon (Terres Inovia)
Financement : MétaProgramme INRA SMaCH

 
2010-2014 : “Caractérisation de gènes de résistance, de gènes d’avirulence et de facteurs d’agressivité dans l’interaction L. maculans-colza”
Coordination : MH. Balesdent
Financement : CETIOM (terres Inovia)

 
2010-2013. ANR “Fungisochores”
“Isochores and effectors: genome reshaping and the birth of highly pathogenic species in fungal phytopathogens”

Coordination : T. Rouxel
Partenariat : INRA URGI (Versailles), INRA-PACE (Angers).
Financement : ANR

 
2008-2011: ANR Génoplante AVirLep
“A whole-genome-based search for Leptosphaeria maculans avirulence and aggressiveness genes to improve management of resistance genes of oilseed rape to stem canker disease”.
Coordinateur : MH. Balesdent
Partenariat : INRA IGEPP (H. Brun, R. Delourme, A-M. Chèvre), CETIOM-Terres Inovia (X. Pinochet), Biogemma (B. Grezes-Besset).
Financement : ANR Génoplante

 
2008-2010 : “Genèse et évolution d’une virulence au sein d’un locus d’avirulence complexe impliqué dans la fitness fongique : cas du modèle d’interaction AvrLm4-7/Rlm7 chez Leptosphaeria maculans”.
Coordinateur : MH. Balesdent
Financement : INRA SPE

 
2002-2006 : Marie Curie Training Site FunGene
“Comparative genome organisation in Leptosphaeria maculans and related filamentous fungi”.
Coordinateur : MH. Balesdent
Financement : Union Européenne (projet Marie Curie Training Site)

 
1996-2000 : Projet Européen “IMASCORE”
“Integrated strategies for the management of stem canker of oilseed rape in Europe”
Coordinateur : MH. Balesdent
Partenariat : Instituto Superior de Agronomia (ISA); Lisbonne, Portugal. University of Göttingen, Allemagne. Rothamsted Experimental Station, (IACR)-Rothamsted, Harpenden UK. CETIOM, France. Institute of Plant Genetics (IGR), Polish Academy of Sciences, Poznan, Pologne. DSV (Deutsche Saatveredelung), Lippstadt, Allemagne. Semences Cargill, France.
Financement : Union Européenne (FAIR 4ème PCRD)